部门
部门是特异事故处不可或缺的部分。正是由于各个部门相互协作，构成了特异事故处的总体。该表记录了大部分的部门。该表可能受到异常现象的影响，并非完全正确。
行政部门（Administration）
概述：行政部门是特异事故处的核心部门之一。该部门通常由正副主任，联邦行政人员及各个办公处或基地的领导人组成，并且人员总数不超过20人。行政部门人员的安全应得到最高级别的保障。
行政部门办公室位于特异事故处总部大楼的一个分支当中，并配有单独的安保人员。
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科研部门（Research Department）
概述：科研部门负责被特异事故处收容、控制的异常项目的观测和研究工作，部分设有医学研究科的还会承担新医疗仪器、异常药物和异常医用物品的研制工作，但因为冷战结束后特异事故处的衰落，科研部门在全球异常届甚至特异事故处内部都被冷落，因此该部门在众多工作中被忽视。
科研部门是特异事故处开展异常工作的核心，它通常集中在研究型基地和办公处的所属部门，服从特异事故处总部科研署的统一指挥。科研部门在年度收支预算中支出通常是10％~20％，在科研为主的基地则更高。
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情报部门（Intelligence Department）
概述：情报部门负责个体异常或群体异常的跟踪、对同行组织的渗透与情报工作和帷幕内行动的善后工作，主要由FBI精锐探员和CIA外派特工构成。
情报部门通常只有受到洛杉矶总部特批的基地或办公处才能设立。各个地点下属的情报部门通常是相互独立但合作的关系，一般情况下服从各自的上级。
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监察部门（Oversight Department）
概述：监察部门负责监督特异事故处内部的腐败行为和关于腐败行为的调查取证，其成员由特异事故处成员组成，定期轮换，但你应该知道，这个部门存在感极低。名义上隶属FBI Inspection Division，实由特异事故处处长和FBI监察长联合管辖。
监察部门只设立在办公处。
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后勤部门（Logistics Department）
概述：后勤部门负责与后勤事务相关的工作，大部分的物资采购以及装配工作都由该部门完成。除此之外，办公处和基地的医疗、清洁和维修工作也由该部门承担。因此该部门也被戏称为“清洁工”。
特异事故处的武器装备采购也由此部门承担，因此在该部门上的支出通常是最多的。
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武装部门（Armed Security Department）
概述：武装部门负责收容、控制异常项目和办公处、基地的安保防卫工作，它通常应被分为两部分：警察（调查）、武装力量（控制）。在必要的情况下，该部门可调动办公处附近的警力和军队以协助行动。
每个办公处和基地都应设立武装部以保障人员安全和各类工作的正常进行。
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